A doktori képzés a mesterfokozat megszerzését követően a doktori fokozat (PhD) megszerzésére készít fel. Az egyetemen jelenleg három doktori iskola működik. A doktori képzés a tudományterület sajátosságaihoz és a doktorandusz igényeihez igazodó egyéni vagy csoportos felkészítés keretében folyó képzési, kutatási és beszámolási tevékenység lehet. Doktori képzésben 240 kreditet kell szerezni. A képzési idő 8 félév.