Az Innovábciós Iroda az EKIK keretein belül működő, támogató funkciót ellátó szervezeti egység, amelynek célja az innovációs tevékenység intézményi szintű harmonizálása, továbbá a technológia-transzfer és innováció-menedzsment tevékenység eredmény-szemléletű működtetése és a vállalkozói szemlélet erősítése az egyetemi polgárok körében.