A Neptun Iroda az Egyetemen működő, támogató funkciót ellátó szervezeti egység, amely az irodaigazgató vezetésével működteti a Neptun Egységes Tanulmányi Rendszert, irányítja a hallgatói tanulmányi ügyintézői, illetve intézeti Neptun adminisztrátori feladatokat ellátó munkatársak ezirányú tevékenységét.